根据2025年新疆公办本科院校综合实力排行榜，以下是新疆大学的前十名排名及其特色专业：
新疆大学：作为新疆211工程、“双一流”高校，其马克思主义理论、化学、计算机科学与技术3个学科入选国家一流建设学科，工程学、材料科学进入ESI全球前1%。
石河子大学：211工程、“双一流”院校，以农业科学、临床医学、化工技术为特色，拥有国家重点学科“作物栽培学与耕作学”。
新疆农业大学：农林学科全疆第一，畜牧学、草业科学、水利工程3个学科获评B级。
新疆医科大学：临床医学、药学、预防医学为国家级特色专业，附属6家三甲医院。
新疆师范大学：教育学、中国少数民族语言文学（维吾尔语）两大王牌专业，心理学专业入选国家级一流本科专业。
喀什大学：中国语言文学、教育学双核驱动，南疆基层公务员和双语教师培养基地。
新疆财经大学：经济学、管理学双支柱，会计学、金融学毕业生在新疆金融机构就业竞争力排名第一。
新疆艺术学院：音乐表演、舞蹈学、美术学3个专业通过教育部特色专业认证。
新疆工程学院：能源与动力工程、安全工程两大工科王牌，定向培养煤炭、电力行业技术人才。
昌吉学院：应用型高校代表，化学工程与工艺、网络工程专业对接乌鲁木齐-昌吉工业走廊企业需求。
此外，新疆还有3所211院校，分别是新疆大学、石河子大学和中国石油大学（北京）克拉玛依校区。
