中国科学技术大学有少年班学院、数学科学学院、物理学院、化学与材料科学学院、工程科学学院、信息科学技术学院、计算机科学与技术学院、人工智能与数据科学学院、网络空间安全学院、微电子学院等学院，以下是具体名单一览表，供大家参考，如有变动，以学校最新公布的信息为准。
1、少年班学院2、数学科学学院数学系
计算与应用数学系
概率统计系
3、物理学院物理系
近代物理系
光学与光学工程系
天文学系
工程与应用物理系
4、化学与材料科学学院化学物理系
应用化学系
材料科学与工程系
化学系
高分子科学与工程系
5、工程科学学院近代力学系
精密机械与精密仪器系
热科学和能源工程系
安全科学与工程系
6、信息与智能学部信息科学技术学院：电子工程与信息科学系、自动化系
计算机科学与技术学院
人工智能与数据科学学院
网络空间安全学院
微电子学院
软件学院
7、地球和空间科学学院地球物理与空间科学技术系
地球化学与行星科学系
8、生命科学与医学部生命科学学院：分子生物学与细胞生物学系、神经生物学与生物物理学系、系统生物学系、医药生物技术系
基础医学院
临床医学院
附属第一医院
生物医学工程学院
9、管理学院工商管理系
管理科学系
统计与金融系
10、公共事务学院11、人文与社会科学学院科技史与科技考古系
科技传播系
科技哲学系
心理学系（筹）
12、马克思主义学院13、环境科学与工程系（直属）14、核科学技术学院加速器科学与工程物理系
等离子体物理与聚变工程系
核科学与工程系
15、未来技术学院16、环境科学与光电技术学院（科教融合学院）17、材料科学与工程学院（科教融合学院）18、天文与空间科学学院（科教融合学院）19、纳米技术与纳米仿生学院（科教融合学院）20、应用化学与工程学院（科教融合学院）21、生物医学工程学院（苏州）（科教融合学院）22、能源科学与技术学院（科教融合学院）23、稀土学院（科教融合学院）
