截至目前，南昌大学共有26个学院和1个独立学院，分别是：
1. 机械与汽车工程学院
2. 电气工程及新能源学院
3. 土木工程学院
4. 化学化工学院
5. 材料科学与工程学院
6. 计算机科学与技术学院
7. 软件学院
8. 数学与统计学院
9. 物理学与机电工程学院
10. 生命科学学院
11. 环境与资源学院
12. 食品科学与工程学院
13. 经济管理学院
14. 马克思主义学院
15. 外国语学院
16. 文学院
17. 传媒艺术学院
18. 法学院
19. 政治与公共管理学院
20. 社会与发展学院
21. 医学院
22. 艺术学院
23. 教育科学学院
24. 体育科学学院
25. 江西省民族研究院
26. 国际教育学院
其中，信息工程学院已经并入电气工程及新能源学院成为其一个专业系。
1、医学院，主要是以培养和医学相关专门人才和研究人员为目的；
2、人文学院，地址是南昌市新建区；
3、外国语学院，列入江西省省级重点中学管理系列和招生范畴；
4、第一临床医学院，培养临床医疗人员；
5、艺术与设计学院，由原来的工业设计，包装工程和艺术设计组合而成；
6、法学院，主干课程是学习法律知识；
7、公共管理学院，学习如何管理公共区域；
8、经济与管理学院，课程有经济学和管理学；
9、理学院；
10、生命科学与食品工程学院，主要是研究生命基因和食品。
