设计和培养目标不同。
南京军事学院建立后培养了大批德才兼备、具有先进军事科学知识的高、中级指挥员和参谋人员,编写了大量战略、战役、战术、政治和科学技术教材,包括为全军编写的战役、战术教材,为中国人民解放军的革命化、现代化、正规化建设作出了重要贡献。
哈军工学院培养目标改为研究、设计、制造方面的军事工程师,实施尖端专业集中,常规专业分散的方针。
南京军事学院与哈军工的区别是两个领域的概念,南京军事学院主要是以培养军队中高级指挥人员为目标,而哈军工是以培养军队装备设计与制造的科技人材为主要目标,哈军工为军队全方位的武器装备的设计与制造培养人才。
南京军事学院培养军事人才,指挥人才,军队高级管理人员的军事院校,哈军工是研发武器作战装备的高等学府,历史悠久,所以两个高等学府区别在于一所是培养人才的学校,一所是研究武器装备的学校