军队二级建造师的注册流程与地方二级建造师基本相同，但需要注意的是，军队二级建造师的注册和管理由军队相关部门负责。以下是军队二级建造师注册的步骤：

1.准备材料：首先，需要准备一系列注册所需的材料，包括身份证、毕业证书、职业资格证书、照片等。此外，还需要填写《军队二级建造师注册申请表》和《军队二级建造师注册信息登记表》。

2.提交申请：将准备好的材料提交给所在部队的人事部门或建设管理部门。这些部门会对申请材料进行审核，确保材料的完整性和真实性。

3.审核：审核通过后，人事部门会将申请材料报送至上级主管部门，如军区或军种的建设管理部门。这些部门会对申请材料进行进一步的审核，并决定是否批准注册。

4.注册：如果获得批准，军队相关部门会颁发《军队二级建造师注册证书》。注册成功后，建造师的信息会被录入军队建设行业管理信息系统，以便于后续的执业管理和监督。

5.继续教育：军队二级建造师需要定期参加继续教育，以更新知识和技能。继续教育通常由军队相关部门组织，内容包括法律法规、工程技术、项目管理等方面。

6.变更注册：如果军队二级建造师需要变更工作单位或者注册类别，需要按照上述流程重新提交注册申请。同时，也需要办理相应的证书变更手续。

7.注销注册：当军队二级建造师不再从事相关工作或者达到退休年龄时，需要办理注销注册手续。注销注册后，建造师将不再具备执业资格。

军队二级建造师的注册需要遵循一定的程序和规定，以确保其执业活动的规范性和有效性。在注册过程中，需要密切关注相关政策动态，确保及时完成各项注册手续。