两者之间首先是定义不同，专业监理工程师是指由总监理工程师授权，负责实施某一专业或某一岗位的监理工作。
总监理工程师是由工程监理单位法定代表人书面任命，负责履行建设工程监理合同、主持项目监理机构工作的注册监理工程师。其次，职级不同，总监理工程师的职级要毕专业监理工程师高，也就是说专业监理工程师是总监理工程师的下级。
再次，任职要求不同，专业监理工程师只要是工程师就行了，总监理工程师要国家注册监理工程师。
最后，两者之间的职责不同，专业监理工程师职责
1、参与编制监理规划，负责编制监理实施细则；
2、审查施工单位提交的涉及本专业的报审文件，并向总监理工程师报告；
3、参与审核分包单位资格；
4、指导、检查监理员工作，定期向总监理工程师报告本专业监理工作实施情况；
5、检查进场的工程材料、设备、构配件的质量；
6、验收检验批、隐蔽工程、分项工程；
7、处置发现的质量问题和安全事故隐患；
8、进行工程计量；
9、参与工程变更的审查和处理；
10、填写监理日志，参与编写监理月报；
11、收集、汇总、参与整理监理文件资料；
12、参与工程竣工预验收和竣工验收。
总监理工程师职责
1、确定项目监理机构人员及其岗位职责；
2、组织编制监理规划，审批监理实施细则；
3、根据工程进展情况安排监理人员进场，检查监理人员工作，调换不称职监理人员；
4、组织召开监理例会；
5、组织审核分包单位资格；
6、组织审查施工组织设计、(专项)施工方案、应急救援预案；
7、审查开复工报审表，签发开工令、工程暂停令和复工令；
8、组织检查施工单位现场质量、安全生产管理体系的建立及运行情况；
9、组织审核施工单位的付款申请，签发工程款支付证书，组织审核竣工结算；
10、组织审查和处理工程变更；
11、调解建设单位与施工单位的合同争议，处理费用与工期索赔；
12、组织验收分部工程，组织审查单位工程质量检验资料；
13、审查施工单位的竣工申请，组织工程竣工预验收，组织编写工程质量评估报告，参与工程竣工验收；
14、参与或配合工程质量安全事故的调查和处理；
15、组织编写监理月报、监理工作总结，组织整理监理文件资料。
区别是：
1、概念不同：
“监理工程师”是指经全国统一考试合格，取得《监理工程师资格证书》并经注册登记的工程建设监理人员。 监理工程师是代表业主监控工程质量，是业主和承包商之间的桥梁。
“专业监理工程师”是项目监理机构中按专业或岗位设置的专业监理人员。 当工程规模较大时， 在某一专业或岗位宜设置若干名专业监理工程师。
2、工作内容不同：
监理工程师证可承担总监、高监等岗位职务;持专业监理工程师证则不能。专业监理工程师是岗位职务，相对于总监等岗位而言，在监理项目中承担某一专业的监理工作，如给排水专业、建筑专业等。按规定两者都要持有注册监理工程师执业证。
总之，监理工程师是专业技术人员资格证书，是通过统一组织的考试获取的，经过注册才能上岗，而专业监理工程师是指由总监理工程师授权，负责实施某一专业或某一岗位的监理工作，有相应监理文件签发权，具有工程类注册执业资格或具有中级及以上专业技术职称、2 年及以上工程实践经验的监理人员。
总监理工程师管理所有的专业监理工程师，专业监理工程师则是负责专业内的监理事宜。两者最大的区别是工作范围，岗位职责的不同。性质相同。
总监理工程师和专业监理工程师是在工程监理领域中履行不同职责的两种不同等级的工程师。
总监理工程师是指在建设项目施工中，负责组织、协调、管理整个监理团队，在项目各个阶段对建设工程进行全方位的技术、安全、质量、环保等方面的监督与管理，并向建设单位提供整体技术咨询服务。同时，总监理工程师需要拥有高级职称或者中级以上以上职称，并且具备至少10年以上相关专业经验。
专业监理工程师则是指在总监理工程师领导下，负责建设项目的某一特定领域（如土木工程、机电安装等）进行技术、安全、质量和环保等方面的监督和管理，确保施工符合法律法规和合同要求。同时，专业监理工程师需要拥有相应的职称并具备相关专业经验。
从职责分配上来讲，总监理工程师更注重对整个项目的管理与协调，而专业监理工程师更注重对特定领域的技术实现与控制。
首先，总监理工程师、总监代表、专业监理工程师这三个都首先必须是监理工程师。其中总监理工程师是由监理单位法定代表人书面授权的；总监代表是经监理单位法定代表人同意，由总监理工程师书面授权的；专业监理工程师是根据项目监理岗位职责分工和总监理工程师指令，负责工作的；监理员是经过监理业务培训，具有同类工程相关专业知识，从事具体监理工作的监理人员。但是具体这些都应该具有什么条件，没有明确说明，视个人能力而定。
总监理工程师是指具有注册监理工程师（建设工程）资格的工程师，有权对建设工程施工中的技术质量、安全、进度等方面进行全面检查，及时发现并处理工程施工中的质量问题、技术难点、配合问题等，并向业主和施工单位提供全方位、全过程的技术监理服务。
专业监理工程师是指具有专业监理工程师（建设工程）资格的工程师，主要进行针对某一专业方面的监理工作，如结构、给排水、电气、暖通等专业监理工程师。他们负责对建设工程设计阶段和施工阶段的专业技术问题进行监理，向业主和施工单位提供专业技术监理服务。两者主要区别在于高级别的总监理工程师有权对整个建设工程进行全面监管和技术监理，而专业监理工程师只负责某一专业方面的监理。
