中世纪教会史与现代教会史、基督教哲学、基督教考古学、古代教学史、教会法规、宗教史;

基督教社会学、新约文学、教文学、旧约文学、道德神学、基础神学;

国际法、行政法、法哲学、国家法与行政法、法律史、民法、刑法、政治法、行政法与教会法规、德国公法与外国公法、德国法律史、劳工法与诉讼法、现代法律史、社会保险与商法、贸易法、国际私法、罗马法;

政治经济学与农业经济学、社会政治学;统计学;

病理学、生理学、耳鼻喉科学、儿科学、输血、妇科学、卫生学与细菌学、生物化学、精神病学与神经病学、化学病理学、外科学、神经心理学与复原、医学保险、内科学、医学心理学、应用生理学、牙科学、药理学、核医学、血清学、运动与闲暇医学、免疫生物学、运动医学、食品医学、光学、皮肤病学、生物物理与放射生物学、妇科放射学、神经病学、心脏病学、核医学治疗、病毒学、免疫病理学、解剖学、矫形学、颌骨一面部医学、麻醉学、神经外科、医学史、药理学与毒理学、医学社会学、免疫学、神经病理学、放射学、人类遗传学与人类学;

哲学与教育学、运动、心理学、音乐、艺术史、中世纪拉丁语文学、罗曼语族语文学、古典语文学、现代德国文学、英国文学、英语语言文学、美国语言与文字、民俗学与德国语文学、社会学、斯拉夫学、俄罗斯国情学、斯堪的纳维亚学;

政治学、古代史、中世纪史、经济史与社会史、近代史与东欧史、近代史、史前史;

数学、物理、地球物理、物理化学、无机化学、遗传学、植物学、植物生物化学、分子生物学、微生物学、生物物理、湖沼学、地球植物学、人种学、地理、气象学、地质学、古生物学、矿物学、土壤学、造林、生物木材研究、森林管理、森林政策、森林生物统计、林业学、森林动物学。

弗赖堡大学提供了丰富的专业选择，包括但不限于以下领域：

法学：设有国际法、行政法、法哲学、国家法与行政法等专业。

医学：包括病理学、生理学、耳鼻喉科学、儿科学、输血、妇科学、卫生学与细菌学、生物化学、精神病学与神经病学、心理学等。

艺术与人文科学：如音乐、艺术史、中世纪拉丁语文学等。

自然科学与工程：涵盖无机化学、遗传学、植物学、植物生物化学、电气与电子工程、数学与统计、地理学、体育科学、经济学与计量经济学、农业与林业等。

社会科学：包括商业与管理、化学工程、社会学、教育学、化学、历史学、哲学与神学等。

此外，弗赖堡大学还有7个研究生院，提供广泛的研究生教育机会。该校在多个专业领域享有国际声誉，如医学研究和医疗设施，以及高分子合成材料研究。弗赖堡大学还培养了多位诺贝尔奖获得者，如经济学家Friedlrich August von Hayek和化学家Hermann Staudinger。