“先修课”好处很多，但是因为处于探索阶段，也存在不少问题。
比如被部分网友质疑借机“掐尖”，有失公平；开设课程较少，学生选择余地不大；增加学业负担；乱收费和变相收费先修班学习有弊端，学生年龄越小受影响就越大1、想象力受到约束年龄小的学生，想象力如天马行空，对任何规则性知识的学习，都会给想象力带来约束。学生要面对家长和老师的"你应该这样，你不应该那样”，听话的孩子，完全照做，不听话的，抗争，结果都是一样，丢掉了想象力。
2、注意力不集中都知道年龄小的学生，注意力集中时间短，年龄越小越是如此。虽然先修的知识并不会太难，但相对学生年龄来讲，也需要集中注意力学习。本来就是贪玩的年龄，假期也是放松、休息的时间，却要学生集中注意力学习，用不太强的自制力克制松懈一下的想法，注意力不集中就是正常现象。当注意力不集中成为习惯，就会把这习惯带入小学、中学、甚至大学，以后学习就会遇到更多麻烦。
3、骄傲自满学习了超前的知识，当学生再次回到学校时，成绩肯定会名列前茅，毕竟比别人多学一次。虚荣心膨胀，就变得骄傲自满起来，不能静下心学习。这种现象很普遍，总是有学生在低年级成绩好，等到了高年级时，成绩突然就下来了。学不进去，储备知识用尽，就是这样的结果。
4、厌学现在，学生厌学普遍存在。究其根源，和这种先修班教育也有一定关系。超前学习，学生理解知识就困难，想学会，只能是延长学习时间。长时间的学习容易使人倦怠，也会打击学生的自信，厌学想法也就随之而来了。
