以下是根据2025年泰晤士世界大学排名、QS2025日本大学排名、U.S.News2025日本大学排名以及多个来源的综合信息，整理出的日本排名前500名的大学列表：
东京大学
京都大学
日本东北大学
大阪大学
东京工业大学
名古屋大学
九州大学
北海道大学
筑波大学
东京医科齿科大学
神户大学
广岛大学
早稻田大学
庆应义塾大学
一桥大学
东京农工大学
千叶大学
熊本大学
冈山大学
上智大学
岐阜大学
群马大学
东京都大学
横滨国立大学
同志社大学
国际基督教大学
鹿儿岛大学
京都工艺纤维大学
九州工业大学
明治大学
31. 信州大学
32. 东海大学（日本）
33. 德岛大学
34. 山口大学
35. 青山学院大学
36. 近畿大学
37. 关西学院大学
38. 名古屋工业大学（NIT）
39. 立教大学
40. 埼玉大学
41. 芝浦工业大学
42. 广岛县立大学
43. 金泽大学
44. 新泻大学
45. 长崎大学
46. 立命馆亚洲太平洋大学
47. 横滨市立大学
48. 丰田技术学院
49. 东京科技大学
50. 大阪公立大学
请注意，这个排名是基于多个来源的综合信息，并且排名可能会随着时间和评价标准的变化而有所调整。建议直接参考各个排名机构的官方发布，以获取最准确的信息。
