根据最新的信息，以下是日本医学大学的排名情况：

东京大学医学部：作为日本最顶尖的学府之一，东京大学医学部在医学教育和研究方面享有极高的声誉。其国家医师考试的合格率达到91%，学费相对较低，6年学费约350万日元（约人民币17.5万元）。

京都大学医学部：京都大学医学部是日本历史最悠久的医学教育机构之一，其国家医师考试的合格率为88%。京都大学在基础医学和临床医学领域都有很强的实力。

庆应义塾大学医学部：作为私立大学中的佼佼者，庆应义塾大学医学部的国家医师考试合格率高达97%。然而，私立大学的学费较高，6年学费约2200万日元（约人民币110万元）。

大阪大学医学部：大阪大学医学部在医学研究方面表现优异，其国家医师考试的合格率为91.3%。大阪大学在肿瘤学和神经科学等领域取得了许多突破性成果。

东京科学大学：东京科学大学是东京工业大学和东京医科齿科大学合并而成的新大学，其齿学部在日本乃至世界都处于领先地位。6年学费约410万日元（约人民币20.5万元），国家医师考试的合格率为96.2%。

东北大学医学部：东北大学医学部在医学研究方面一直走在日本医学界的前列，其国家医师考试的合格率为92.6%。该校招收留学生积极，外国留学生中有50%是中国留学生。

九州大学医学部：九州大学医学部是日本南部地区的重要医学研究中心，其国家医师考试的合格率为92.5%。九州大学在癌症治疗和心脏介入领域享有盛誉。

日本医科大学：日本医科大学与庆应义塾大学、东京慈惠会医科大学并称为“医科大学御三家”，其医学教育水平在医科大学中极为有名。6年学费约2800万日元。

这些大学在医学教育和研究方面都处于日本乃至世界的领先地位，具体选择可以根据个人情况和预算进行考虑。