根据2024年和2025年的最新排名数据，合肥市的主要大学排名如下：

中国科学技术大学：稳居合肥市第一，全国排名第3至第9名之间，是我国顶尖的科研型大学，尤其在量子信息、纳米科学等领域具有显著优势。

合肥工业大学：合肥市第二，全国排名第54至第83名，以工科见长，尤其在机械工程、车辆工程等领域具有深厚积累。

安徽大学：合肥市第三，全国排名第81至第86名，是安徽省属重点大学，文理学科均衡发展，尤其在化学、生物学等领域表现突出。

安徽医科大学：合肥市第四，全国排名第139至第154名，是安徽省内知名的医科院校，皮肤病与性病学、免疫学等学科为优势学科。

安徽农业大学：合肥市第五，全国排名第153至第158名，以农林学科为主，生态农业等领域有较强实力。

安徽建筑大学：合肥市第六，全国排名第270至第271名，以建筑和土木工程为特色。

合肥大学：合肥市第七，全国排名第216至第287名，近年来发展迅速，尤其在应用型人才培养方面表现突出。

安徽中医药大学：合肥市第八，全国排名第263至第349名，中医药学科为优势。

合肥师范学院：合肥市第九，全国排名第365至第367名，以师范教育为特色。

巢湖学院：合肥市第十，全国排名第373至第485名，是合肥市综合实力较好的本科院校。

此外，合肥市还有一些民办大学和专科院校，如安徽新华学院（民办本科排名第一）、合肥职业技术学院（高职院校排名第一）等。

以上排名数据来源于多个权威榜单，包括软科、校友会等，具体排名可能因榜单标准不同而有所差异。