根据最新的检索结果，世界大学发表论文的排名可以从多个角度进行评估，以下是几种主要的排名方式和相关数据：

软科世界大学学术排名（ARWU）

软科世界大学学术排名是全球最具影响力和权威性的大学排名之一，主要依据学术表现进行排名。2024年的排名中，哈佛大学连续22年蝉联全球第1，斯坦福大学和麻省理工学院分别位列第2和第3。英国剑桥大学和牛津大学分别位居第4和第6。

泰晤士高等教育世界大学排名（THE）

泰晤士高等教育世界大学排名基于18项绩效指标，涵盖教学、研究环境、研究质量、国际展望和产业等方面。2025年的排名中，牛津大学连续蝉联榜首，麻省理工学院和哈佛大学分别位列第2和第3。

全球顶刊《Nature》和《Science》发文排名

在《Nature》和《Science》这两大顶级学术期刊上的发文数量也是衡量大学科研水平的重要标准。2024年，哈佛大学以117篇的发文量位居全球第一，中国科学院以102篇紧随其后。斯坦福大学、麻省理工学院和剑桥大学分别位列第3、第4和第5。

中国内地高校表现

中国内地高校在《Nature》和《Science》上的表现也非常突出。中国科学院大学、北京大学和清华大学分别位列全球第6、第9和第10。此外，南方科技大学和西湖大学等新兴高校也取得了显著成绩。

总结来看，哈佛大学、斯坦福大学、麻省理工学院等美国高校在全球论文发表排名中占据领先地位，而中国内地高校如中国科学院大学、北京大学和清华大学也在全球科研舞台上展现了强劲实力。