总公司代替签订的合同对分公司有效,双方分别签订的合同对分公司无效。分公司只要是在总公司的授权范围内对外签订的合同即为有效,超出总公司授权范围签订的合同为效力待定合同,分公司超出总公司的授权范围为他人签订保证合同的,该保证合同无效。
法律依据

《中华人民共和国公司法》第十四条公司可以设立分公司。设立分公司,应当向公司登记机关申请登记,领取营业执照。分公司不具有法人资格,其民事责任由公司承担。公司可以设立子公司,子公司具有法人资格,依法独立承担民事责任。
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